ник: час
Ну так создаем новый файл, экспортируем в него таблицы (без данных) из текущей бд
Данные лежат в третьей базе.
Потому её сразу и копируем (создавая новый файл сразу с таблицами нужных структур)
рвём связи
В таблицах удалям ненужное
И сжимаем программно